Industriellement, trois procédés de production des micro algues sont actuellement utilisés:
De ces modes de culture sont produites des Chlorelles aux propriétés et compositions variables. Selon qu'elles sont produites à la lumière ou non, à l'air libre ou pas, leur composition sera différente notamment dans leur teneur en vitamine B12, avec des bactéries associées ou non ....
Les procédés en milieu hétérotrophique n'utilisent pas la réaction de photosynthèse de l'algue qui se développe en consommant les sucres du milieu de culture. Cette Chlorella ne contient pas de vitamine B12.
La production des Chlorella en photo bio réacteurs ou dans des tubes de verre, est plus de 10 fois plus couteuse qu'en réacteurs hétérotrophes. Quant à la production en bassins ouverts elle est seulement 5 fois plus élevée que la production la moins couteuse.
Ces coûts industriels expliquent que très souvent les producteurs en bassin à ciel ouverts commencent la production en réacteurs hétérotrophes puis poursuivent en bassins ouverts pour la phase finale.
Les productions en bassins à ciel ouvert ne peuvent pas éviter le contact avec l'environnement et ses contaminants, qu'ils proviennent de l'air (le vent, les insectes, les oiseaux), mais aussi de l'eau (pluie), la terre (poussières). Il est nécessaire de stériliser les productions ainsi obtenues.
Le mode de stérilisation physique utilisé ne peut éviter le fractionnement des cellules.de Chlorella. D‘un inconvénient technique les promoteurs de cette Chlorella en on fait un argument de vente en expliquant que les cellules de la Chlorelle devaient être ouvertes pour être digestes, ce qui est bien évidemment faux puisque la membrane reste non assimilable par notre organisme. Par contre les cellules de Chlorella ouvertes ne protègent plus son précieux contenu.Plus de la majorité des Chlorella cultivées et consommées dans le monde est produite en réacteurs hétérotrophes. Il est possible de trouver sur le marché de produit très peu chers.
La production en photo-bio-réacteurs ou en tubes de verre, s'effectue en milieu entièrement contrôlé et sécurisé. Tous les «entrants» sont sous contrôle. La photosynthèse, favorisée par la lumière naturelle, permet à la plante de se développer.
Moins de 1% de la production mondiale est cultivée dans ces conditions. Mais seule ce type de production, sous tubes de verre, peut permettre de garantir le meilleur niveau de qualité de la Chlorella. Les coûts de production de cette Chlorelle imposent des prix de ventes plus élevés par rapport aux autres Chlorella, c'est le prix de la qualité.
Il n'existe qu'une usine de production industrielle de micro algue Chlorelle. Elle est située en Allemagne à Klötze. Elle n'est entrée en production que depuis quelques années.